影响因子：8.8

研究概述：

(资料图片仅供参考)

卵巢透明细胞癌(OCCC)是上皮性卵巢癌的一种组织学亚型，具有独特的临床和生物学特征。OCCC的疾病侵袭性和化疗耐药性是当前面临的严峻挑战。目前尚无有效靶向治疗OCCC的方法。本研究对中国OCCC患者队列进行了基因组学和转录组学分析,探索可能的预后生物标志物和不同的亚型，并结合免疫基因表达特征，开发免疫分类器和免疫治疗的候选生物标志物，这有助于OCCC的个性化治疗。

研究结果：

一、患者特征：50例患者纳入标准及分期等情况（表1）

二、通过对OCCC的转录组学分析，确定了两种亚型

1、对患者数据进行免疫通路相关层次聚类确定了两个不同亚型，亚型1（免疫组）的15个免疫相关通路的表达量显著高于亚型2（非免疫组）（图1a-b）。

2、免疫组患者的复发率更高，生存率更短。Kaplan-Meier曲线显示，免疫亚型患者在两个人群队列中往往有更差的OS。(图1c-e).

三、两个亚群显示出不同的免疫图谱和信号通路

利用转录组数据及xCell算法发现，免疫组的免疫细胞水平显著升高，CD4、细胞毒性T淋巴细胞(CTL)等免疫相关基因在免疫簇中显著上调，GSEA图显示了与非免疫亚型相比，免疫亚型中PD-1信号通路的富集，Hallmark基因集显示两种亚型表现出明显不同的富集模式（图2a-d）。

四、两种免疫亚型中OCCC和显著突变基因的基因组景观

1、图3a显示了队列中基因改变的分布情况，与以往的研究一致，最常见的突变基因是ARID1A和PIK3CA。

2、OCCC中的肿瘤突变负担(TMB)较低，两个亚组之间无显著性差异(图3b)。免疫亚型患者有更高的PIK3CA突变率，并且PI3K-AKT通路确实在免疫亚型中富集(图3c)。

五、OCCC患者预后免疫特征的构建和验证

1、尝试基于该队列构建OCCC患者的预后免疫特征。首先，对免疫组和非免疫组进行差异表达分析。通过LassoCox回归分析，共有15个基因保持个体系数，并导致免疫评分差异，免疫评分和FIGO分期被证明是影响总生存率的独立预后因素(图4a-c)。此外，研究表明免疫评分甚至比分期更稳健（图4d-e）。

2、基于TCGA数据，免疫分类也是肾透明细胞癌的独立预后因素(图4f)。然而，该分类不能用于卵巢癌的其他组织学亚型，包括浆液性和子宫内膜样组织学(图4g、h、i)。

研究总结：

本研究通过整合基因组和转录组分析，描述了两种不同功能和预后的OCCC分子亚型。该免疫亚群在PD-1和PI3K-AKT-mTOR信号通路中富集。基于研究数据，构建了一个稳健的OCCC患者的预后免疫特征，并在公共存储数据集中验证其具有可重复性。免疫/非免疫分类对靶点治疗的预测作用具有重要的优点，这将为OCCC的个性化治疗提供新的理论依据。